基础医学是延安大学的老牌和品牌学科，基础医学教育直接关系到陕北医疗事业的进步和发展，因此基础医学学科建设一直是学院学科建设和发展的出发点和支撑点。

以现已建成的人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学、病原生物学三个校级重点扶持学科为基础，2013年基础医学学科获批陕西省高水平大学学科建设项目；2014年获批陕西省普通高等学校优势学科建设项目，这标志着我院“基础医学”已跨入省级重点建设学科行列；2016年获批一级硕士学位授权点；2017年基础医学一级学科入选陕西省“双一流”建设计划。

学院一直高度重视基础医学学科建设工作，在“医教协同”管理体制改革、学科方向凝练、科研平台及科研团队建设、人才引进及培养、学术合作与交流、培养基地拓展等方面进行了一系列的积极的改革、探索和实践，对标省一流学科建设、博士点申报培育要求，打基础、夯实力、找差距、补短板、强特色，不断推进基础医学学科建设工作。依托陕西省科研团队肿瘤细胞分子与表观调控研究创新团队、延安市肿瘤防治重点实验室、延安市慢性病防治重点实验室、延安市神经科学重点实验室和延安市微生物药物创新与转化重点实验室，聚焦肿瘤分子机制、神经损伤修复、微生物与新药研发、中药药理等，形成以基础医学为主的多学科集群，构建陕北医药研发基地，为陕西医疗、科技、经济发展提供技术支撑和平台，服务并促进陕西医药卫生、教育、科技、经济和社会的可持续发展。